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菌種投培
菌種培養構筑物的選擇：方便操作，有曝氣裝置，有攪拌，利于加菌種、進原水或營養液的構筑物。菌種在投加時，方案設定應根據現場具備的條件綜合考慮。如場地、施工、運輸車輛、臨時電源、臨時泵及管道、水槍、高差、過濾等因素。菌種的粉碎對于壓縮污泥應考慮污泥的粉碎問題，應根據現場的條件確定粉碎方法。粉碎方法選擇的順序為水槍——泵循環+濾網沖擊——曝氣、攪拌。
菌種活性降低時，首先加入恢復菌種，恢復其活性。由于菌種脫離其原來的好氧環境往往已有較長時間，因此，菌種運輸到現場后應盡快加入培養構筑物，并且加入時，使構筑物處于曝氣過程，每批加完后繼續曝氣，一方面淘汰，另一方面將構筑物內的營養物質消耗，恢復其活性。
菌種的培養在活性恢復后即進入培養階段，目的是使活性污泥盡快生長，以達到一定的數量級。菌種活性恢復期間，同時自身也有部分增殖。菌種的培養可單獨進行，也可與馴化同步進行，通常是以培養為主，即污泥量增加為主，兼顧馴化。如原水濃度較高或毒性較強，培養時應以加營養液或生活污水為主；如原水基本無毒性，碳氮比適當，可在培養階段以原水為主。
活性泥馴化
活性污泥馴化應遵循的原則循序漸進、有的放矢、精心控制的。活性污泥馴化的方法與技巧如果培養期間加入的主要是生活污水，這個時候逐步降低生活污水的加入量，并逐步增加原水的進水量，每次增加的進水量為設計進水量的5—10%，每增加一次應穩定2-3個周期或2天左右，發現系統內或出水指標上升應繼續維持本次進水量，直至出水指標穩定，如出水指標一直上升，應暫停進水，待指標恢復正常后，進水量應稍微減少，或略大于上周期進水量。
以此類推，最終達到系統設計符合。活性污泥馴化時，也可采用體積負荷法來進行馴化，可根據化驗數據、進水指標、系統指標、構筑物體積推算出單位時間的系統污泥負荷，根據體積負荷來確定下個周期的進水量。
